یکی از شاگردان کندی را برای مناظره به سوی او فرستاد، کندی درمانده گشته و کتابی را که در این باره نوشته بود، سوزانید.16 برخی وی را فردی بخیل و ناجوانمرد توصیف نموده و حکایاتی را در همین زمینه از وی نقل کرده اند.17 بنا به گفته شاگردش ابومعشر، کندی در اواخر عمر به مرض اعصاب مبتلا شد و عقلش زایل گشت و از دنیا رفت.18 تاریخ دقیق وفات وی معلوم نیست، ولی برخی منابع آن را در حدود 260 هـ ، و آثار و تألیفات وی را بالغ بر سیصد اثر دانسته اند.19 الندیم آثار وی را در بخش های مختلف فلسفه، منطق، حساب، کره، موسیقی، نجوم، هندسه، فلک، طب، احکام، جدل، روان شناسی، سیاست، احداث، ابعاد، تقدمیّات و علوم متفرقه دسته بندی کرده است که از این قرارند:20یعقوب ـ کندی

آثار فلسفی: الفلسفة الاولی فیما دون الطبیعیات و التوحید الفلسفة الداخله و المسائل المنطقیه و المعتاصه و مافوق الطبیعیات رسالة فی انّه لا تنال الفلسفه الاّ بعلم الریاضیات الحث علی تعلم الفلسفه ترتیب کتب ارسطالیس کتاب فی قصد ارسطالیس فی المقولات ایاها قصداً و الموضوعة لها مائیة العلم و اقسامه اقسام العلم الانسی رسالة فی مقیاس العلمی که شامل دو رساله است: رساله ای بزرگ و رساله ای مختصر کتاب فی انّ افعال الباری کلها عدل لا جور فیها کتاب فی مائیة الشیء الذی لا نهایة له و بایّ نوع یقال الذی لا نهایة له رسالة فی الابانه انّه لا یمکن ان یکون جرم العالم بلانهایه و انّ ذلک انّما هو فی القوة الفاعلة و المنفعلة من الطبیعیات الاولی عبارات الجوامع الفکریة مسائل سئل عنها فی منفعة الریاضیات اوائل الاشیاء المحسوسه کتاب فی بحث قول المدعی انّ الاشیاء الطبیعیه تفعل فعلا واحداً بایجاب الخلقه رسالة فی الترفق فی الصناعات رسالة فی رسم رقاع الی الخلفاء و الوزراء رسالة فی قسمة القانون و رسالة فی مائیة العقل و الابانة عنه.

آثار منطقی: رسالة فی المدخل المنطقی که شامل دو رساله کوتاه و بلند می باشد رسالة فی المقولات العشر رسالة فی الاحتراس من خدع السوفسطائیین رسالة فی الابانة عن قول بطلیموس فی کتابه المجسطی و عن قول ارسطالیس فی انالوطیقا رسالة فی اختیار الکتب الاربعه رسالة فی البرهان المنطقی که شامل دو رساله مختصر و طولانی است رسالة فی الاصوات الخمسه رسالة فی سمع الکیان و رسالة فی عمل آلة مخرجة الجوامع.

آثار وی در علم حساب: رسالة فی المدخل الی الارثماطیقی رسالة فی استعمال الحساب الهندی رسالة فی الابانه عن الاعداد التی ذکرها افلاطن فی کتابه السیاسة رسالة فی تألیف الاعداد رسالة فی التوحید من جهة العدد رسالة فی استخراج الخبئی و الضمیر رسالة فی الزجر و الفأل من جهة العدد رسالة فی الخطوط و الضرب بعدد الشعیر رسالة فی الکمیة المصافه رسالة فی النسب الزمانیه رسالة فی الحیل العددیة و علم اضمارها و کتاب الدوالیب «دهمذح».

کتاب های او در کرویات: رسالة فی انّ العالم و کلّما فیه کری الشکل رسالة فی ان سطح ماء البحر کری رسالة فی الابانة عن انّه لیس شیء من العناصر الاولی و الجرم الاقص غیر کری رسالة فی انّ الکرة اعظم الاشکال الجرمیه و الدائرة الاعظم من جمیع الاشکال البسیطه رسالة فی تسطیح الکره رسالة فی الکریات رسالة فی عمل السمت علی کره و رسالة فی عمل حلق الست و استعمالها.

کتاب های او در موسیقی: رسالة فی التألیف رسالة فی ترتیب النغم الدالة علی طبائع الاشخاص العالیة و تشابه التألیف رسالة فی رسالة الایقاع رسالة فی المدخل الی صناعة الموسیقی رسالة فی خبر صناعة التألیف رسالة فی صناعة الشعر و رسالة فی الاخبار عن صناعة الموسیقی.

کتاب های او در نجوم: رسالة فی انّ رؤیة الهلال تضبط بالحقیقة و انما القول فیها بالتقریب رسالة فی مسائل سئل عنها من احوال الکواکب رسالة فی جواب مسائل طبیعیه فی کیفیات نجومیه رسالة فی مطرح الشعاع رسالة فی فصلین رسالة فیما ینسب الیه کل بلد من البلدان الی برج من البروج و کوکب من الکواکب رسالة فیما سئل عنه من شرح ما عرض له الاختلاف فی صور الموالید رسالة فیما حکی من اعمار الناس فی الزمن القدیم و خلافها فی هذا الزمن رسالة فی تصحیح عمل نمودارات الموالید و الهیلاج و الکتخداه رسالة فی ایضاح علة رجوع الکواکب رسالة فی الشعاعات رسالة فی سرعة ما یری من حرکة الکواکب اذا کانت فی الافق و ابطائها کلما علت رسالة فی الابانة عن الاختلاف الذی فی الاشخاص العالیة رسالة فی فصل ما بین التسییر و عمل الشعاع رسالة فی علل الاوضاع النجومیه رسالة الی الاشخاص العالیة المسماة سعادة و نحاسه رسالة فی علل القوی المنسوبه الی الاشخاص العالیة الدالة علی المطر رسالة فی علل احداث الجوّ و رسالة فی العلة التی لها یکون بعضی المواضع «لاتکاد تمطر».